El ministro generó polémica al afirmar que el Gobierno "rechaza la diversidad de identidades sexuales que no se alineen con la biología". Estas palabras desataron críticas, especialmente después de que el vocero presidencial, Manuel Adorni, aclarara que el gobierno de Javier Milei sostiene que "es infinito cómo uno se puede autopercibir y el Estado no puede interferir en esta autopercepción".

La Federación Argentina LGBT+ calificó las declaraciones de Cúneo Libarona como "inaceptables" y las consideró una muestra de "profunda ignorancia" por parte de un funcionario que debería proteger los derechos humanos fundamentales en lugar de vulnerarlos. En su comunicado, la organización exigió que el ministro se retracte de sus palabras o presente su renuncia y llamó a las autoridades a respetar y garantizar los derechos de la comunidad LGBT+.

Además, la Federación reafirmó la importancia de respetar la identidad de género y la orientación sexual de cada persona, subrayando que no permitirán retrocesos en materia de derechos humanos en Argentina.

Figuras mediáticas, como el periodista Luis Novaresio, también se sumaron a las demandas de disculpas o renuncia del ministro. Sin embargo, la dimisión de Cúneo Libarona parece improbable, según las declaraciones de Adorni, quien defendió al ministro durante su conferencia de prensa, indicando que el gobierno defiende la libertad de elección en todos los ámbitos.